[開設 01/17/08]
[更新 01/21/16]
形式概念分析の適用例
コウガイビル，カタツムリ，タコ，ナメクジウオ，ヒトの分岐分析
「分岐学とは何か４：ホモプラシー その１・収斂」
「分岐学とは何か５：最節約な基準で分岐図を選ぶ 証拠の数を最大に」
(北村雄一氏のHP)
より
対象
コウガイビル，カタツムリ，タコ，ナメクジウオ，ヒト
属性
肛門をもつ，
レンズ眼をもつ，
外套膜をもつ，
足・頭・内臓塊と並んだ身体の構造をもつ，
歯舌をもつ，
脊索をもつ
文脈表（その1）
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肛門
|
レンズ眼
|
外套膜
|
足・頭・内臓塊
|
歯舌
|
脊索
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コウガイビル
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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カタツムリ
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1
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0
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1
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1
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1
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0
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タコ
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1
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1
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1
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1
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1
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0
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ナメクジウオ
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1
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0
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0
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0
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0
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1
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ヒト
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1
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1
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0
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0
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0
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1
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概念束（その1）
「キノコ，ワラビ，タンポポ，ヒマワリの分岐分類」と同様に，
対象の名義尺度 (nominal scale) 文脈との並置 (apposition) をとる．
文脈表（その2）
|
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肛
門
|
レ
ン
ズ
眼
|
外
套
膜
|
足
・
頭
・
内
臓
塊
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歯
舌
|
脊
索
|
コ
ウ
ガ
イ
ビ
ル
|
カ
タ
ツ
ム
リ
|
タ
コ
|
ナ
メ
ク
ジ
ウ
オ
|
ヒ
ト
|
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コウガイビル
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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0
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カタツムリ
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1
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0
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1
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1
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1
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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タコ
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1
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1
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1
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1
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1
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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ナメクジウオ
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1
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0
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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1
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0
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ヒト
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1
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1
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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0
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1
|
概念束（その2）
上図から
最小元を削除しても木（分岐図）にならない．
図から，
最も単純な操作で木に変形するには（最節約基準），
レンズ眼を同形形質と見なせばよいことがわかる
（最節約などについての詳細は，
「分岐学とは何か４：ホモプラシー その１・収斂」，
「分岐学とは何か５：最節約な基準で分岐図を選ぶ 証拠の数を最大に」
を参照）．
文脈表（その3）
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|
肛
門
|
レ
ン
ズ
眼
⌢
タ
コ
⌣
|
レ
ン
ズ
眼
⌢
ヒ
ト
⌣
|
外
套
膜
|
足
・
頭
・
内
臓
塊
|
歯
舌
|
脊
索
|
コ
ウ
ガ
イ
ビ
ル
|
カ
タ
ツ
ム
リ
|
タ
コ
|
ナ
メ
ク
ジ
ウ
オ
|
ヒ
ト
|
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コウガイビル
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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0
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カタツムリ
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1
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0
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0
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1
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1
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1
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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タコ
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1
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1
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0
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1
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1
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1
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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ナメクジウオ
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1
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0
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0
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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1
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0
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ヒト
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1
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0
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1
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0
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0
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0
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1
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0
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0
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0
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0
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1
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概念束（その3）
上図から
最小元を削除すれば，
「分岐学とは何か５：最節約な基準で分岐図を選ぶ 証拠の数を最大に」
と同じ分岐図が得られる．
Concept Explorer データ ファイル
convergence.cex (26KB：右クリックでダウンロードしてください)
分岐分析への適用について
概念束から（多少の試行錯誤により）最節約な分岐図を得ることができるのは，
文脈表（データ行列）が小規模な場合だけでしょう
分岐分析では，
規模の大きいデータ行列から最節約に基づいて分岐図を生成するソフトウェアがあるようです．
そのようなソフトがあれば形式概念分析は不要かと思います．
ここでは，
形式概念分析の適用可能性を示すために例示しました．
なお，
北村雄一氏の「恐竜と遊ぼう」
誠文堂新光社 (2002)
は小学生向けの本のようですが，
分岐学の良い入門書になっていると思います（私は分岐学の素人ですが，楽しく読めました）．
この本の例題にも形式概念分析を適用することができます
（「マイナスの輪ゴム」も実現できます）．
東工大 学生 向け 分岐分析関連 参考書
東工大の図書館に下記の書籍があります
（リンク先は東工大図書館 図書情報です）．
-
「生物の種多様性」
-
第 3 章「系統樹をつくる」が参考になります．
-
「動物分類学の論理」
-
§ 3.3 が「分岐分類学」です．
-
「系統分類学 : 分岐分類の理論と実際」
-
まるごと分岐分類学の教科書です．
形式概念分析の適用事例
